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Résumé : Les lacs interconnectés du système Faguibine, situés dans la région de Tombouctou au Mali, constituent un ensemble hydrologique composé de (05) lacs naturels, historiquement vital pour l’agriculture, la pêche, et l’élevage dans la sous-région. Cependant, ce territoire fait face à une dégradation constante liée aux effets conjugués des changements climatiques et des actions anthropiques. L’objectif de cette étude est d’analyser les enjeux et défis socio-économiques, environnementaux liés à l’aménagement des lacs interconnectés du système Faguibine, ainsi que les perspectives pour sa réhabilitation et sa gestion durables. Les données climatiques portant sur la pluviométrie, la température et hydrologiques ont été collectées dans les services techniques et ERA5. Nous avions consulté également de nombreux ouvrages se rapportant au thème et récolté des données au cours de trois mois d’enquête de terrain. L’échantillon était constitué de 320 exploitants et de personnes ressources rencontrées dans la zone d’étude. L’analyse des résultats révèle une variation des régimes pluviométriques, une baisse drastique des ressources en eau et un ensablement sans précédent de chenaux d’alimentation. Les défis majeurs de la zone d’étude sont dus d’une part aux aléas climatiques marqués par des sécheresses récurrentes et un remplissage aléatoire des lacs et d’autre part à un ensablement des chenaux, rendant difficile la circulation de l’eau du fleuve Niger vers les lacs. Les enjeux d’aménagement des lacs interconnectés du Système Faguibine reposent sur la restauration hydraulique du réseau de chenaux pour rétablir la remise en eau régulière des lacs, tout en renforçant les activités agropastorales et halieutiques. Les perspectives pour les lacs interconnectés du système de Faguibine incluent la mise en place de programmes de développement durable combinant une gestion intégrée des ressources naturelles, l’encouragement d’une gouvernance locale participative et l’adaptation aux changements climatiques. Mots-clés : Problématique d’aménagement, enjeux, lacs interconnectés, système Faguibine et perspectives, Tombouctou.